Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BNC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BNC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BNC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H3BNC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BNC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BNC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BNC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BNC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H3BNC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
H3BNC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BNC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BNC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BNC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H3BNC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BNC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BNC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BNC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BNC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BNC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H3BNC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H3BNC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BNC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H3BNC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BNC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BNC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BNC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BNC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
H3BNC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H3BNC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
H3BNC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
H3BNC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BNC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BNC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BNC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H3BNC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BNC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BNC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BNC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BNC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BNC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BNC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BNC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BNC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BNC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BNC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BNC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BNC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BNC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BNC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BNC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BNC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BNC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BNC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BNC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BNC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BNC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BNC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BNC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BNC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BNC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BNC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BNC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H3BNC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BNC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BNC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BNC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BNC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BNC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BNC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BNC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BNC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BNC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BNC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BNC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BNC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BNC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BNC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BNC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BNC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms