Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BMQ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BMQ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BMQ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BMQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BMQ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BMQ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BMQ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BMQ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BMQ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BMQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BMQ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BMQ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BMQ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3BMQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BMQ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BMQ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3BMQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BMQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BMQ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BMQ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BMQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BMQ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3BMQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3BMQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BMQ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BMQ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BMQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BMQ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BMQ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3BMQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H3BMQ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3BMQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3BMQ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BMQ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BMQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BMQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BMQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H3BMQ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3BMQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms