Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
F8VP50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8VP50 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8VP50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
F8VP50 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
F8VP50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
F8VP50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
F8VP50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F8VP50 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F8VP50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8VP50 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8VP50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8VP50 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8VP50 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8VP50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8VP50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8VP50 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8VP50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8VP50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8VP50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
F8VP50 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
F8VP50 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F8VP50 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8VP50 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8VP50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8VP50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8VP50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8VP50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8VP50 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8VP50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8VP50 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8VP50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8VP50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8VP50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8VP50 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8VP50 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8VP50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8VP50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8VP50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8VP50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8VP50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8VP50 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8VP50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8VP50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8VP50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
F8VP50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
F8VP50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
F8VP50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
F8VP50 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
F8VP50 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
F8VP50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms