Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms