Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L11C9JVI0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L11C9JVI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms