Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9IYK1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9IYK1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9IYK1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9IYK1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9IYK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9IYK1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9IYK1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9IYK1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9IYK1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C9IYK1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C9IYK1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9IYK1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9IYK1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9IYK1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9IYK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9IYK1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9IYK1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9IYK1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9IYK1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9IYK1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9IYK1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C9IYK1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C9IYK1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C9IYK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9IYK1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9IYK1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9IYK1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9IYK1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9IYK1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9IYK1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9IYK1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9IYK1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9IYK1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9IYK1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9IYK1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9IYK1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9IYK1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9IYK1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9IYK1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9IYK1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9IYK1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9IYK1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9IYK1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9IYK1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9IYK1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9IYK1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9IYK1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9IYK1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9IYK1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9IYK1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C9IYK1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9IYK1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9IYK1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9IYK1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9IYK1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9IYK1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9IYK1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9IYK1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C9IYK1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms