Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4E1Z4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4E1Z4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4E1Z4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4E1Z4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4E1Z4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
B4E1Z4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4E1Z4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4E1Z4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4E1Z4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4E1Z4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
B4E1Z4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
B4E1Z4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4E1Z4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4E1Z4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4E1Z4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4E1Z4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4E1Z4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4E1Z4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4E1Z4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4E1Z4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4E1Z4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4E1Z4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4E1Z4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4E1Z4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4E1Z4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4E1Z4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
B4E1Z4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4E1Z4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4E1Z4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4E1Z4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
B4E1Z4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4E1Z4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
B4E1Z4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4E1Z4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4E1Z4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4E1Z4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4E1Z4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
B4E1Z4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4E1Z4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
B4E1Z4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4E1Z4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4E1Z4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4E1Z4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4E1Z4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4E1Z4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4E1Z4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4E1Z4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4E1Z4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4E1Z4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4E1Z4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
B4E1Z4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4E1Z4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4E1Z4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4E1Z4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4E1Z4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4E1Z4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4E1Z4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4E1Z4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B4E1Z4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
B4E1Z4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4E1Z4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4E1Z4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4E1Z4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4E1Z4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4E1Z4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4E1Z4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4E1Z4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4E1Z4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4E1Z4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4E1Z4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4E1Z4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4E1Z4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4E1Z4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4E1Z4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4E1Z4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
B4E1Z4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4E1Z4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4E1Z4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms