Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4EB2RXH2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms