Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO5BA8MYB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMCO5BA8MYB1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO5BA8MYB1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms