Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNCNA6PVL3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNCNA6PVL3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms