Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLCD2A6NGC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLCD2A6NGC4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms