Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1LA6NDD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNDIG1LA6NDD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms