Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIT2A6NDA9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRIT2A6NDA9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIT2A6NDA9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms