Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT87PA6NCN2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT87PA6NCN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms