Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GMNCA6NCL1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GMNCA6NCL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms