Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FITM1A5D6W6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms