Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XIRP2A4UGR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XIRP2A4UGR9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XIRP2A4UGR9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms