Protein–RNA interactions for Protein: A1A580

KRTAP23-1, Keratin-associated protein 23-1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP23-1A1A580 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP23-1A1A580 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP23-1A1A580 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms