Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM30CPA0ZSE6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM30CPA0ZSE6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30CPA0ZSE6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms