Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F8A0AVK6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F8A0AVK6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F8A0AVK6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms