Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV2A0A0J9YWF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRBV2A0A0J9YWF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV2A0A0J9YWF9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms