Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF3AQ9Y2N7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms