Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDUFA12Q9UI09 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDUFA12Q9UI09 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms