Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms