Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC10Q9NYD6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC10Q9NYD6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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