Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KXD1Q9BQD3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KXD1Q9BQD3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms