Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms