Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4DQ92854 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEMA4DQ92854 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEMA4DQ92854 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEMA4DQ92854 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SEMA4DQ92854 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4DQ92854 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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