Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HAPLN4Q86UW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HAPLN4Q86UW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms