Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms