Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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NCAPHQ15003 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NCAPHQ15003 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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NCAPHQ15003 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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