Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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