Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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CDH18Q13634 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH18Q13634 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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