Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms