Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BNIP1Q12981 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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