Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms