Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MPP1Q00013 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms