Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms