Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB2P29033 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB2P29033 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms