Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms