Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL2P13500 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL2P13500 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL2P13500 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms