Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APELAP0DMC3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms