Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD63P08962 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD63P08962 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD63P08962 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD63P08962 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD63P08962 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms