Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC9O60706 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms