Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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USP17L12C9JPN9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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