Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms