Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms