Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J203 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J203 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J203 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms