Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIMKLBQ9ULI2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms