Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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